a.分类（classification）：是根据一定的原则（特征的相似性或系统发育相关性）对微生物进行分群归类，并对各个分类群的特征进行描述；b.命名（nomenclature）：是根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称；c.鉴定（identification）：则是借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定新发现的或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程